李子霖博士

Zilin Li, Ph.D.

细胞死亡与免疫实验室

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邮箱: lizilin@westlake.edu.cn

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李子霖博士

Zilin Li, Ph.D.

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追求真理,踏实创新;以人为本,全面发展。

个人简介

2008.08 - 2012.06,学士(生物科学),浙江大学

2012.07 - 2016.12,博士(生物化学),新加坡国立大学

2017.01至今,博士后(邵峰实验室),北京生命科学研究所

将于2025年加入西湖大学,任助理教授/博士生导师,于应急医学研究中心组建实验室开展独立研究。


学术成果及研究方向

死亡是生命体所面临的终极事件,生物的基本单元——细胞,亦如是。上至万物之灵的人类,下至简单的微生物细菌,都具有精密的细胞死亡程序。细胞焦亡是一类由gasdermin家族膜打孔蛋白所介导的裂解性细胞死亡,是一种高度保守和重要的抗感染天然免疫机制。博士后期间,跟随领域奠基人邵峰院士,我对细胞焦亡相关的生物化学机制进行深入研究,取得了具有高度创新性的科学发现。我的研究揭示了志贺氏菌——引起细菌性痢疾的主要肠道致病菌,通过分泌效应蛋白OspC3高效地抑制细胞焦亡的发生,从而逃逸了这种天然免疫机制。我们进一步发现OspC3的生化功能是催化一种全新的蛋白质翻译后修饰(ADP-riboxanation),有趣的是这一类效应蛋白广泛存在于细菌中,并参与调控多种宿主细胞功能。

微生物感染范畴之外,焦亡也在多种生物学场景中发生,而我们对于这种高度促炎性的细胞死亡如何与机体的其他程序(免疫、代谢、发育等)相互协调与影响,及其底层的分子机制,知之甚少。这是本领域下一阶段亟待解答的重要科学问题,而对这些问题的理解亦会促进对炎症相关疾病的认知以及推动免疫治疗/疫苗方法的革新。

未来本实验室将综合运用各种研究体系和技术手段,聚焦病原微生物感染以及细胞死亡,致力于探索:1,病原微生物调节免疫过程的新机制;2,细胞死亡发生和调控的新机制及其生理病理意义。


代表论文

1. Li Z, Liu W, Fu J, Cheng S, Xu Y, Wang Z, Liu X, Shi X, Liu Y, Qi X, Liu X, Ding J, Shao F. Shigella evades pyroptosis by arginine ADP-riboxanation of caspase-11. Nature. 2021 Nov;599(7884):290-295.

Commented on Nat Microbiol (PMID: 34931049) and recommended by Faculty of 1000.


Recent publications


1. Zhang Q*, Xian W*, Li Z, Lu Q, Chen X, Ge J, Tang Z, Liu B, Chen Z, Gao X, Hottiger MO, Zhang P, Qiu J, Shao F, Liu X. Shigella induces stress granule formation by ADP-riboxanation of the eIF3 complex. Cell Rep. 2024 Feb 27;43(2):113789.

2. Hou Y*, Zeng H*, Li Z, Feng N, Meng F, Xu Y, Li L, Shao F, Ding J. Structural mechanisms of calmodulin activation of Shigella effector OspC3 to ADP-riboxanate caspase-4/11 and block pyroptosis. Nat Struct Mol Biol. 2023 Mar;30(3):261-272.

3. Liu Y*, Zeng H*, Hou Y, Li Z, Li L, Song X, Ding J, Shao F, Xu Y. Calmodulin Binding Activates Chromobacterium CopC Effector to ADP-Riboxanate Host Apoptotic Caspases. mBio. 2022 Jun 28;13(3):e0069022.

4. Wang K*, Sun Q*, Zhong X, Zeng M, Zeng H, Shi X, Li Z, Wang Y, Zhao Q, Shao F, Ding J. Structural Mechanism for GSDMD Targeting by Autoprocessed Caspases in Pyroptosis. Cell. 2020 Mar 5;180(5):941-955.e20.


* equal contribution


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